Assassin's Creed Shadows a primit recenzii foarte bune încă de la anunțarea sa. Lansarea jocului este încă departe, dar mulți și-au format deja propriile opinii cu privire la joc.
Principala sursă de controverse este încercarea Ubisoft de a prezenta personajul principal ca o persoană cu genealogie africană, Yasuke, ca un samurai în Occident, când nu există dovezi istorice credibile din acea epocă care să stabilească faptul că a fost ridicat din sclavie, ci a fost de fapt un samurai, nu doar un bodyguard. Faptul că, pentru prima dată în istoria jocurilor Assassin's Creed, unul dintre personajele principale ale jocului nu este un personaj local din acea epocă, ci un străin care a trăit de câțiva ani în Japonia, este încă sub semnul întrebării, dar există și probleme în jurul jocului care ar putea avea consecințe juridice reale din cauza greșelilor Ubisoft.
Personalul canadian al Ubisoft a făcut o mulțime de cercetări cu privire la epoca respectivă, deși accentul a fost probabil pus pe interpretarea corectă din punct de vedere politic a învățăturilor confuciene și pe rescrierea constantă a paginilor Wikipedia, mai degrabă decât pe revizuirea lucrărilor de artă orginale. Ubisoft a început să folosească steagul unui grup tradiționalist voluntar, fără permisiune, pe mai multe lucrări de artă conceptuale și pe ediția de colecție a jocului.
Cei care folosesc steagul, a anunțat imediat că va lua măsuri legale împotriva Ubisoft, dar se pare că au reușit să rezolve problema în timp, deoarece Ubisoft și-a cerut scuze public pentru utilizarea neautorizată a acestuia.
Steagul nu va mai fi folosit de Ubisoft în viitor, însă nu va putea fi îndepărtat din cartea care vine cu versiunea de colecție.
Ubisoft a făcut mai multe greșeli în timpul materialelor de marketing pentru Shadows, au pus logo-ul familiei greșite pe statuia ediției de colecție, dar și caracterele Kanji sunt greșite pe cutia cadou, destinat pentru producătorii de conținut.